Российские учёные изобрели новый алгоритм для сравнения геномов

genom

Статья коллаборации российских ученых из Университета ИТМО, МФТИ и ФНКЦ ДГОИ, посвященная новому методу обработки метагеномов, была опубликована в журнале Bioinformatics. Как известно, геном — это совокупность генов одного организма, тогда как метагеном — совокупность генов организмов, живущих в одной и той же среде.

Разумеется, различные методики сравнения геномов существуют уже очень давно, однако, разработка отечественных учёных, именуемая MetaFast, на порядок опережает по скорости все существующие алгоритмы. Скорость обработки данных этим способом поражает: более одного миллиарда метагеномов было сравнено менее, чем за 36 часов!

Перспективы использования данной методики практически безграничны. В медицине она позволит выявлять не только различные болезни кишечника, кожи и других органов, заселенных микроорганизмами, но и предрасположенности к ним! Достаточно будет сравнить метагеном кишечника пациента с кишечником здорового человека, чтобы сразу диагностировать такие заболевания, как диабет, цирроз, а также гастроэнтерит. Польза для экологии будет заключаться в сравнении метагеномов двух биомов, с целью определения их состояния и предсказания путей развития. В антропологии же станет возможно быстрое сравнение двух людских популяций. Особенно интересные данные должны появиться при сравнении двух изолированных популяций, сохранивших традиционный уклад.

Рейтинг:
[всего голосов: 2, средний: 5]

Рекомендуем почитать

Неандертальцы могли исчезнуть от воздействия дыма ... Известно, что род Homo, наряду с человеком разумным, состоял и из других видов людей, таких, к примеру, как денисовцы или неандертальцы. Однако эв...
США могут лишить учёных мира крупнейшего радиотеле... После сокращения финансирования Национального научного фонда США может быть закрыт крупнейший радиотелескоп Земли. «Аресибо» был построен в 196...
В Черном море случайно нашли 40 затонувших корабле... В пресс-релизе, опубликованном Саутгемптонским университетом, рассказано о неожиданной находке, сделанной на Черном море совместной экспедицией бр...
Горилла, гуляющая на двух ногах... Наши меньшие братья нередко преподносят сюрпризы и не перестают удивлять попытками подражать человеку снова и снова. На первых строчках хит-парада...

Читайте также:  Протезы для хождения могут заменить инвалидные коляски

ПРОЕКТУ НУЖНА ВАША ПОМОЩЬ

Комментарии:

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *