Российские учёные изобрели новый алгоритм для сравнения геномов

genom

Статья коллаборации российских ученых из Университета ИТМО, МФТИ и ФНКЦ ДГОИ, посвященная новому методу обработки метагеномов, была опубликована в журнале Bioinformatics. Как известно, геном — это совокупность генов одного организма, тогда как метагеном — совокупность генов организмов, живущих в одной и той же среде.

Разумеется, различные методики сравнения геномов существуют уже очень давно, однако, разработка отечественных учёных, именуемая MetaFast, на порядок опережает по скорости все существующие алгоритмы. Скорость обработки данных этим способом поражает: более одного миллиарда метагеномов было сравнено менее, чем за 36 часов!

Перспективы использования данной методики практически безграничны. В медицине она позволит выявлять не только различные болезни кишечника, кожи и других органов, заселенных микроорганизмами, но и предрасположенности к ним! Достаточно будет сравнить метагеном кишечника пациента с кишечником здорового человека, чтобы сразу диагностировать такие заболевания, как диабет, цирроз, а также гастроэнтерит. Польза для экологии будет заключаться в сравнении метагеномов двух биомов, с целью определения их состояния и предсказания путей развития. В антропологии же станет возможно быстрое сравнение двух людских популяций. Особенно интересные данные должны появиться при сравнении двух изолированных популяций, сохранивших традиционный уклад.

Рейтинг:
[всего голосов: 2, средний: 5]

Рекомендуем почитать

Собака помогла задержать вора букета цветов... В Пермском крае ротвейлер Грей помог раскрыть кражу в цветочном магазине. Из цветочного торгового центра, который принимает за день множество поку...
В Германии собака породы колли усыновила лисёнка... В аварии на одной из автострад Германии задавили лисицу. Рядом с телом мёртвой матери был найден чудом уцелевший детёныш в возрасте трёх недель. О...
Йога в жизни современного человека... Йога в давно превратилась из редкого хобби для горстки почитателей восточной экзотики в неотъемлемую часть фитнес-индустрии с многомиллионными ден...
Овраги на Марсе могли сформироваться без участия ж... Издательство Geophysical Research Letters опубликовало исследование ученых Университета им. Джона Хопкинса, проводивших изучение некоторого количе...

Читайте также:  Протеины могут служить заменой антибиотикам

ПРОЕКТУ НУЖНА ВАША ПОМОЩЬ

Комментарии:

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *