Российские учёные изобрели новый алгоритм для сравнения геномов

genom

Статья коллаборации российских ученых из Университета ИТМО, МФТИ и ФНКЦ ДГОИ, посвященная новому методу обработки метагеномов, была опубликована в журнале Bioinformatics. Как известно, геном — это совокупность генов одного организма, тогда как метагеном — совокупность генов организмов, живущих в одной и той же среде.

Разумеется, различные методики сравнения геномов существуют уже очень давно, однако, разработка отечественных учёных, именуемая MetaFast, на порядок опережает по скорости все существующие алгоритмы. Скорость обработки данных этим способом поражает: более одного миллиарда метагеномов было сравнено менее, чем за 36 часов!

Перспективы использования данной методики практически безграничны. В медицине она позволит выявлять не только различные болезни кишечника, кожи и других органов, заселенных микроорганизмами, но и предрасположенности к ним! Достаточно будет сравнить метагеном кишечника пациента с кишечником здорового человека, чтобы сразу диагностировать такие заболевания, как диабет, цирроз, а также гастроэнтерит. Польза для экологии будет заключаться в сравнении метагеномов двух биомов, с целью определения их состояния и предсказания путей развития. В антропологии же станет возможно быстрое сравнение двух людских популяций. Особенно интересные данные должны появиться при сравнении двух изолированных популяций, сохранивших традиционный уклад.

Рейтинг:
[всего голосов: 2, средний: 5]

Рекомендуем почитать

В России появился робот-андроид для полетов в косм... Газета «Комсомольская правда» сообщила о создании в России робота-андроида, предназначенного для использования в космических полетах. В своем сооб...
Сидящий на комете зонд «Филы» «проснулся» и готов ... Европейский зонд «Филы», находящийся сейчас на поверхности кометы 67P/Чурюмова-Герасименко, летящей к Солнцу, вновь начал работать. Отправленный в...
Головоногие моллюски При взгляде на осьминога кажется, что он состоит только из головы, за которую принимают его мешкообразное тело, и восьми щупалец- ног — отсюда и п...
Роскосмос разработает новую сверхтяжелую ракету... Вполне возможно, что госкорпорация «Роскосмос» откажется от строительства ракеты-носителя «Ангара-А5В» сверхтяжелого класса. Данная ракета, оснаще...

Запись обновлена


Читайте также:  Канадским ученым удалось вырастить человеческое ухо из яблока

ПРОЕКТУ НУЖНА ВАША ПОМОЩЬ

Комментарии:

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *