Российские учёные изобрели новый алгоритм для сравнения геномов

genom

Статья коллаборации российских ученых из Университета ИТМО, МФТИ и ФНКЦ ДГОИ, посвященная новому методу обработки метагеномов, была опубликована в журнале Bioinformatics. Как известно, геном — это совокупность генов одного организма, тогда как метагеном — совокупность генов организмов, живущих в одной и той же среде.

Разумеется, различные методики сравнения геномов существуют уже очень давно, однако, разработка отечественных учёных, именуемая MetaFast, на порядок опережает по скорости все существующие алгоритмы. Скорость обработки данных этим способом поражает: более одного миллиарда метагеномов было сравнено менее, чем за 36 часов!

Перспективы использования данной методики практически безграничны. В медицине она позволит выявлять не только различные болезни кишечника, кожи и других органов, заселенных микроорганизмами, но и предрасположенности к ним! Достаточно будет сравнить метагеном кишечника пациента с кишечником здорового человека, чтобы сразу диагностировать такие заболевания, как диабет, цирроз, а также гастроэнтерит. Польза для экологии будет заключаться в сравнении метагеномов двух биомов, с целью определения их состояния и предсказания путей развития. В антропологии же станет возможно быстрое сравнение двух людских популяций. Особенно интересные данные должны появиться при сравнении двух изолированных популяций, сохранивших традиционный уклад.

Рейтинг:
[всего голосов: 2, средний: 5]

Рекомендуем почитать

5 июня – официальный праздник российских экологов... 5 июня – международно признанный праздник тех, кто любит природу и готов работать на её сохранение и процветание. В 1972 году ООН был учреждён Все...
Поев сладкого, шмели становятся большими оптимиста... Легко допускается, что высшие животные могут испытывать чувства. В принципе, подобное даже наблюдалось у некоторых птиц и допустимо у земноводных....
Краткие сведения о ядовитых растениях для с/х скот... С приближением лета на полях и лугах вырастает много кустов, трав, цветов и ягод, но некоторые из них очень опасны для здоровья сельскохозяйственн...
Мурманские спасатели вызволили забравшуюся в кварт... Дикие животные, проникшие в обыкновенную квартиру - проблема, которая стала возникать все чаще и чаще. Яркое тому подтверждение недавний случай: в...
Читайте также:  Канадским ученым удалось вырастить человеческое ухо из яблока

ПРОЕКТУ НУЖНА ВАША ПОМОЩЬ

Комментарии:

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *